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非洲猪瘟病毒等温扩增快速检测方法DB21/T 3256—2020.pdf

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非洲猪瘟病毒等温扩增快速检测方法DB21/T 3256—2020.pdf

ICS 11.220 B 41 DB21 辽宁省 地 方 标 准 DB21/T 3256 2020 非洲猪瘟 病毒等温 扩增快速 检测方法 Loop-mediated Isothermal Amplification(LAMP)for Rapid Detection for African Swine Fever Virus 2020-04-30 发布 2020-05-30 实施 辽 宁 省 市 场 监 督 管 理 局 发布 DB21/XXXXX XXXX I 前 言 本标准 按 照GB/T 1.1 2009 给 出的 规则 起草。本 标准 由辽 宁省 农业 农村厅 提出 并归 口管 理。本标准 起草 单位:辽宁 省 农业发 展服 务中 心、中 国 科学院 微生 物研 究所、洛 阳莱普 生信 息科 技有 限公司、辽宁 佰瑞 生物 科技 有限公 司。本标准 主要 起草 人:杨作 丰、周 晨阳、李 秀梅、王 宏燕、杨利 敏、董娜、刘 文军、张皓 淳、姚 伟、刘洋、刘近、吴 洪涛、任 雪建、赵培、李 蓉、章春 燕、吕 园园、陈腾。本标准 发布 实施 后,任何 单 位和个 人如 有问 题和 意见 建议,均可 以通 过来 电和 来 函等方 式进 行反 馈,我们将 及时 答复 并认 真处 理,根 据实 际情 况依 法进 行评估 及复 审。归口管 理部 门通 讯地 址:辽 宁省农 业农 村厅(沈 阳市 和 平区太 原北 街2 号),联 系电 话:024-23447862;标准起 草单位 通讯 地址:辽宁省 动物及 产品 检疫中 心(沈 阳市沈 河区 万柳塘 路105号 甲),联 系 电话:024-24229579。DB21/T 3256 2020 1 非 洲猪瘟 病毒等温 扩增快 速检测方 法 1 范围 本标准 规定 了非 洲猪 瘟病 毒等温 扩增 快速 检测 方法 的技术 要求。本标准 适用 于非 洲猪 瘟疫 病的诊 断、监测 及流 行病 学调 查,适 用于 猪血 液、脾脏、淋巴 结、肾 脏 等组织样 品中 非洲 猪瘟 病毒 核酸的 快速 检测。2 规范性 引用 文件 下列文 件对 于本 文件 的应 用是必 不可 少的。凡 是注 日期的 引用 文件,仅 所注 日期的 版本 适用 于 本 文件。凡 是不 注日 期的 引用 文件,其最 新版 本(包括 所有的 修改 单)适用 于本 文件。GB 19489 实 验室 生 物 安全通 用要 求 3 原理 非洲猪 瘟病毒 是一 种DNA 病 毒,该 检测方 法利 用6条 特 异性引 物和具 有链 置换能 力的DNA 聚合 酶,在等温环 境下1 h 内完 成扩 增,用于 非洲 猪瘟 病毒 的核 酸检测。4 仪器和 器材 4.1 高 速台 式冷 冻离 心机(离心 范 围020000 r/min)4.2 冰 箱:4 1 冰 箱,-20 1 冰箱,-7 1 冰 箱 4.3 恒温 LAMP 扩增 仪(型 号:Gene-8C)4.4 离 心管:15 ml 离心 管、1.5 ml 离 心管 和0.2 ml PCR 专 用离 心管 4.5 微 量移 液器:1000 l,200 l,100 l,50 l,20 l,10 l,2 l 5 试剂和 引物 5.1 样 品处 理剂 5.2 ASFV-R-Mix 5.3 Bst enzyme 5.4 D-I 矿 物油 5.5 阳 性对 照 5.6 阴 性对 照 注:本技术规范中使用的试剂,除另有说明外,所有实验使用的试剂等级均为不含DNA 或DNase 的分析纯或生化试剂;所有试剂均用无菌的容器分装。DB21/T 3256 2020 2 6 操作步骤 6.1 样品的 采集、前 处理、存 放与运 输 6.1.1 采样 注意 事项 采集样 品及 样品 前处 理过 程中应 戴一 次性 手套,样 本间不 得交 叉污 染。6.1.2 采样 工具 15 ml 离 心管 和1.5 ml 离 心 管经121 1 高压 灭菌20 min;剪刀、镊子 经160 干热 灭菌2 h,无菌管(真空 采血 管)。6.1.3 组织 病料 的采 集与 前处理 采集疑 似非 洲猪 瘟病 毒感 染猪的 肺脏、肝 脏、肾脏、脾脏等 组织 样品,用 无菌 的剪刀 和镊 子剪 取 待检样品 约10 g 于 组织 匀浆 器或研 钵中 充分 匀浆 或研 磨,加 入0.3 ml 0.5 ml 组 织悬液 混匀,60,30 min灭活后,将 悬液 转入 无菌Eppendorf 管 中,4 条件 下5000 r/min离心10 min,编号 备用。6.1.4 全血 及血 清样 本的 采集与 前处 理 使用含 有抗 凝血 剂(EDTA-紫色盖)的无 菌管(真空 采血管)从耳 静脉 或前 腔 静脉采 集血 液3 ml 5 ml,60,30 min 灭活 后,可直 接检测;若 检测血 清,可 静置全 血样 本待血 清析出 后,直 接吸 取至 无菌Eppendorf 管 中,60,30 min 灭 活后,编 号备 用。6.1.5 存放 与运 输 采集或 处理的 样品 在28 条件 下保存 应不 超过24 h;若需 长期 保存,应放 置-70 冰箱,但应避免反 复冻 融(冻融 不超 过3次)。采集 的样 品密 封 后,采 用保 温壶 或保 温桶 加冰密 封,在8 h 之内 运送到实验 室检 测。按照 兽 医实验 室生 物安 全技 术管 理规范 进 行样 品的 生物 安全标 识。6.2 样品DNA 的 提取 取10 l前 处理 过的 样本 加入无 菌1.5 ml 离心 管,加 入10 l样 品处 理剂,混 匀,94 裂 解2 min,瞬时离 心,上清 即为 扩增 模板。6.3 核酸扩 增 6.3.1 吸取22 l ASFV-R-Mix 和1 l Bst enzyme 加入 同一 个PCR 管,吸 取 2 l 步骤6.2 处理 的核酸扩 增模 板加 至PCR 管,混匀,设 置阴 阳性 对照;6.3.2 吸取10 l D-I 矿 物油 轻 轻加 至PCR 管液 面,切勿 震荡混 匀;6.3.3 插入到 恒温 扩增 仪反 应槽 中;6.3.4 设置恒 温扩 增仪 器反 应条 件为:65 反 应 12 min,荧光 采集 周 期20 s。7 试验成 立条 件与 结果 判定 7.1 试验成 立条 件 使用前 用阴、阳 性对 照进 行该检 测方 法评 价,若阳 性对照CT值40,阴 性对 照CT值40,则 检 测 结果有效。DB21/T 3256 2020 3 7.2 结果判 定 若CT值40,样品 应判 定 为非洲 猪瘟 病毒 核酸 阳性;若CT值40,样品 应判 定 为非洲 猪瘟 病毒 核酸阴性 8 实验室 生物 安全 要求 按照GB19489 实 验室 生物 安全 通 用要 求执 行。DB21/T 3256 2020 4 A A 附 录 A(规范 性附 录)试剂配 制 A.1 样品 处理 剂的 制备 量取80 ml PBS(0.01 mol/L,pH 值7.4),加 入10 l NP40(乙 基苯 基聚乙 二醇),无菌 纯化 水定容至100 ml,定量 分装,500 l/管,-20 保 存。A.2 ASFV-R-Mix 的 制备 A.2.1 引 物合 成 根据非 洲猪 瘟病 毒p72 基 因 片段的 保守 结构 域设 计3 对 引物,包括1对 内引 物(FIP 与BIP)、1对 外引物(F3 与B3)和1对 环引 物(LF与LB),均 由上 海生 工生物 工程 股份 有限 公司 合成,序列 为:FIP:5-TAACGCCACTATGCAGCCCACGGAAGAGCTGAATCTCTATCCT-3 BIP:5-CAACATGTGCGAACTTGTGCCACATACCTGGAACGTCTCC-3 F3:5-ATAGGTAATGCGATCGGATACA-3 B3:5-CCAACAATAACCGCCACGC-3 LF:5-TCGCCACGCAAAGATAAGC-3 LB:5-AGCCTCGGTGTTGATGCGGATT-3 A.2.2 引 物混 合物 的制备 取3对引 物(FIP、BIP、F3、B3、LF 和LB)干 粉,按 引物说 明书分 别加 入适量 无菌纯 化水,溶解 混匀,得 到各 引物 溶液,置-20 保存。A.2.3 ASFV-R-Mix 的配 制 称取2.4 g Tris,0.37 g 氯化钾,0.12 g 硫酸镁,100 l 吐温-20,7.029 g甜菜碱,溶于80 ml纯化水,依次 加入 终浓 度 为1.4 mmol/L dNTPs 溶液、0.2 mol/L 外 引物 溶液、1.6 mol/L 内 引物 溶液、0.8 mol/L 环引 物溶液,加入无 菌纯化 水定 容至100 ml,经 过0.22 m 滤器 过 滤除菌,分装 至2 ml 蓝盖可立 冻存 管中,1.1 ml/管,-20 保存。A.3 Bst enzyme 的 制备 用于 制备本试剂盒 的Bst enzyme 为商品化DNA 聚合 酶,按 使用说明书用 纯化水稀释 至4106/L,分装至0.5ml 白盖 可立 冻存 管中,100/l 管,-20 保存。A.4 D-I矿 物油 用于制备本试剂盒的D-I矿物油为商品化矿物油,分装至2 ml 黄 盖 可 立 冻 存 管 中,500 l/管,-20 保存。A.5 阳性 对照 采用核 酸蛋 白质 分析 仪测 定阳性 质控 品浓 度,计算 质粒拷 贝数,用 纯化 水将 其稀释 为103拷贝/l,分装至0.5 ml 红 盖可 立冻 存管中,100 l/管,-20 保 存。A.6 阴性 对照 取纯化 水,分装 至0.5 ml 绿盖可 立冻 存管 中,100 l/管,-20 保存。DB21/T 3256 2020 5 _

注意事项

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