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猫泛白细胞减少症诊断 实时荧光PCR法DB22/T 2788-2017.pdf

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猫泛白细胞减少症诊断 实时荧光PCR法DB22/T 2788-2017.pdf

ICS 11.220 B 41 DB22 吉林省地方标准 DB 22/T 27882017 猫泛白细胞减少症诊断 实时荧光PCR法 The diagnostic of Feline panleukopenia virus Real-time PCR method 2017-12-11发布 2018-04-01实施吉林省质量技术监督局 发布 DB22/T 27882017 I 前 言 本标准按照 GB/T 1.1-2009 和 GB/T 20001.4-2015 给出的规则起草。本标准由吉林省畜牧业管理局提出并归口。本标准起草单位:吉林省畜牧兽医科学研究院、吉林农业大学、吉林省动物疫病预防控制中心。本标准主要起草人:程荣华、呼延含蓉、王开、郭衍冰、王楠、丁世杰、邵洪泽、于钦磊、白翠、李昱洁、陆伟、何浩、刘沂霖、赵欣、肖玉海、王辉。DB22/T 27882017 1 猫泛白细胞减少症诊断 实时荧光PCR 法 1 范围 本标准规定了猫泛白细胞减少症实时荧光PCR方法的缩略语、材料、操作步骤和结果判定。本标准适用于猫泛白细胞减少症的实验室诊断。2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法 3 缩略语 下列缩略语适用于本文件。PCR:聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction)Ct:循环阈值(Cycle threshold)DNA:脱氧核糖核酸(Deoxyribonucleic acid)4 材料 4.1 仪器设备 4.1.1 分析天平,感量 0.1 mg。4.1.2 高速冷冻离心机,12 000 r/min 以上。4.1.3 荧光定量 PCR 扩增仪。4.1.4 冰箱,2 8 和-20 两种。4.1.5 可调移液器,最大量程为 10 L,200 L,1 000 L。4.1.6 恒温水浴锅,控温范围为室温至 100。4.1.7 高压蒸汽灭菌器。4.1.8 干热箱。4.2 器械与耗材 4.2.1 组织匀浆器或研钵。4.2.2 医用剪刀。4.2.3 医用镊子。4.2.4 1.5 mL 离心管。4.2.5 15 mL 离心管。4.2.6 50 mL 离心管。DB22/T 27882017 2 4.2.7 1 000 mL 量筒。4.2.8 1 000 mL 容量瓶。4.2.9 PCR 八联排管。4.2.10 吸头,10 L,200 L,1 000 L。4.2.11 医用棉签。4.3 试剂 除有特殊说明外,所有实验用试剂均为分析纯,实验用水应符合 GB/T 6682 中一级水的要求。4.3.1 0.02 mmol/L PBS,见附录A。4.3.2 基因组 DNA提取试剂盒。4.3.3 SYBR Premix Ex Taq II(Tli RNaseH Plus)(2)。4.3.4 灭菌双蒸水。4.4 引物 上游引物 F:5-AATGCTTGGGGAGTTTGGTTT-3。下游引物 R:5-TTTAGTTGGTGGCTGAGTAGCAGA-3。5 操作步骤 5.1 采样器具前处理 5.1.1 组织匀浆器或研钵(4.2.1)、医用剪刀(4.2.2)、镊子(4.2.3)经160 干热灭菌2 h。5.1.2 离心管经 121 2 高压蒸汽灭菌 15 min。5.2 样品的采集和处理 5.2.1 用拭子(4.2.11)采集猫眼周分泌物、鼻液、粪便,采集样品的拭子用少量 PBS(4.3.1)浸润后,3 000 r/min 离心 15 min,取上清液待检。5.2.2 采集病死猫肠道、肝、脾等组织器官,加等体积 PBS(4.3.1)研磨匀浆,3 000 r/min 离心 15 min,取上清液待检。5.3 DNA 提取 按照基因组 DNA 提取试剂盒说明书要求操作,提取的基因组 DNA 应迅速进行荧光定量 PCR 扩增,或置于-20 冰箱(4.1.4)备用。5.4 反应体系 5.4.1 实时荧光 PCR 扩增反应体系见表 1。表1 实时荧光 PCR 反应体系 试剂 剂量 上游引物 F(10 mol/L)1.0 L 下游引物R(10 mol/L)1.0 L 待检样品DNA 2.0 L 灭菌双蒸水 8.5 L DB22/T 27882017 3 表1(续)试剂 剂量 SYBR Premix Ex Taq II(Tli RNaseH Plus)(2)12.5 L 总体积 25.0 L 5.4.2 以灭菌双蒸水为阴性对照,以猫泛白细胞减少症病毒基因组 DNA 或含目的片段的阳性质粒为阳性对照。5.5 反应程序 实时荧光 PCR 反应程序见表 2。表2 实时荧光 PCR 反应程序 反应步骤 温度 时间 s 循环数 次 第一步 95 30 1 95 5 第二步 60 30 40 6 结果判定 6.1 结果分析条件设定 试验检测结束后,根据收集的荧光曲线和 Ct 值直接读取检测结果,Ct 值为每个反应管内的荧光信号达到设定的阈值时所经历的循环数。阈值设定原则以阈值线刚好超过正常阴性对照品扩增曲线的最高点,不同仪器可对阈值线的位置进行调整,然后读取检测结果。6.2 质控标准 6.2.1 阴性对照无 Ct 值并且无典型扩增曲线。6.2.2 阳性对照的 Ct 值应35.0,并出现特定的扩增曲线。6.2.3 如阴性对照和阳性对照不满足以上所有条件,实验结果视为无效。6.3 结果描述及判定 6.3.1 无 Ct 值,无典型的扩增曲线或反应曲线无明显对数增长期,判为阴性。6.3.2 Ct 值35.0,出现典型的扩增曲线,判为阳性。6.3.3 35.0Ct 值40.0,出现特定的扩增曲线,样品判为疑似。应重新采样检测,结果仍为疑似,判定为阳性。DB22/T 27882017 4 A A 附 录 A(规范性附录)磷酸缓冲生理盐水 A.1 A液 0.2 mol/L 磷酸氢二钠溶液,称取磷酸氢二钠(Na2HPO412H2O)71.64 g,先加适量去离子水溶解,最后定容至 1 000 mL,混匀。A.2 B液 0.2 mol/L 磷酸二氢钠溶液,称取磷酸二氢钠(NaH2PO42H2O)31.21 g,先加适量去离子水溶解,最后定容至 1 000 mL,混匀。A.3 0.02 mol/L pH7.2 磷酸盐缓冲生理盐水(PBS)的配制 量取 0.2 mol/L 的 A 液 360 mL,0.2 mo1/L 的 B 液 140 mL,称取氯化钠 38 g,用去离子水溶解稀释至 5 000 mL,4 保存。_

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